Pour conserver la tranquillité et la beauté de l'île de Fregate sans heurter l'équilibre fragile de son écosystème, Fregate Island Private s'est volontairement limitée à des villas d'une superficie de 300 à 400 mètres carrés (3200 à 4300 pieds carrés). Construites avec des matériaux traditionnels comme l'acajou local et le teck africain de style épuré avec montants et linteaux, les villas sont recouvertes d'un épais toit de chaume. Aussi bien l'architecture que le décor présentent des influences balinaises et thaïlandaises. Quatorze des villas se trouvent au sommet des falaises avec une vue panoramique sur l'océan Indien. Deux autres sont nichées dans leur jardin tropical privé ; ces dernières sont idéales pour les familles en vacances avec des enfants en bas âge. 

Chaque villa est placée de manière à s'intégrer dans le paysage environnant pour garantir aux hôtes un maximum d'intimité et d'isolement. Des parois coulissantes en verre et des portes vitrées, pouvant être ouvertes sur les éléments, permettent d'estomper totalement la séparation entre l'intérieur et l'extérieur. 

Malgré leur apparence traditionnelle et leur atmosphère extrêmement décontractée, les villas sont confortablement équipées avec lecteurs de DVD et CD. Et, naturellement, si la brise du large ne vous semble pas assez rafraîchissante, il y a toujours la climatisation à votre disposition.